占有面積が複数ボクセルで高さが１の建物の描画で起こるものと思います。
問題の起きる建物を高さ2に書きかえればとりあえず対処できます。
（高架下駅の場合はこの方法は使えないです。）
牧草地はこの問題を避けるため高さ2にしています。
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